Le financement global de la recherche atteint plus de 59 millions $. En avril 2007, le Conseil d'administration de l'Université adopte la Politique de la recherche et de la création. Signataire de la Déclaration de Berlin sur le libre accès à la connaissance, l'UQAM procède au lancement du site Internet Archipel, l'archive des publications électroniques issues des travaux de recherche des professeurs de l'Université.
Une chaire de recherche du Canada en génomique intégrative et signalisation cellulaire (Sarah Jenna) est créée à la Faculté des sciences. L'UQAM soutient également la création de la Chaire en gestion de projet (Brian Hobbs) en collaboration avec plusieurs partenaires dont Hydro-Québec, l'Agence métropolitaine de transport, Ericsson et Dessau. En collaboration avec Centre jeunesse Montréal-Institut universitaire, la Chaire d'étude sur l'application des connaissances dans le domaine des jeunes des familles en difficulté (François Chagnon) voit également le jour.